هواپيمايي ماهان با مجوز و تأييد سازمان هواپيمايي كشوري به عنوان يك شركت هواپيمايي خصوصي در سال 1371 تأسيس شد. مؤسسه خيريه مولي‌الموحدين از سهامداران اصلي هواپيمايي ماهان است.

عمليات پروازي هواپيمايي ماهان از ارديبهشت سال 1372 با دو فروند توپولوف 154 و دو فروند ايلوشين 76 باري آغاز شد. مسيرهاي پروازي در سال اول به كرمان و مشهد، در شبكه داخلي و مشهد به دمشق در شبكه پروازهاي بين‌المللي محدود بود.
تعداد مسافر حمل شده در سال 1372 در شبكه پروازي ماهان 142 هزار نفر بود، در حالي كه اين رقم در سال 1384 به 5/1 ميليون نفر افزايش يافت.

از آنجايي كه بهره‌برداري از يك هواپيماي مدرن غربي توسط يك شركت خصوصي در ايران سابقه نداشته است،

هواپيمايي ماهان با خريد سه فروند ايرباس A300B4 در سال 1378 تحول اساسي در تاريخچه ماهان و صنعت هواپيمايي كشور ايجاد كرد. به دنبال اين جهش هواپيماهاي دور برد ايرباس A310 و همچنين باريك پيكر A320 نيز در هواپيمايي ماهان مورد بهره‌برداري قرار گرفت.

در حال حاضر هواپيمايي ماهان با برقراري پروازهاي برنامه‌اي به 3 كشور در اروپا توانسته است با موفقيت تهران را به عنوان يك نقطه ترانزيت مسافر بين‌المللي مطرح كند. پرواز به خاور دور و خاورميانه و بهره‌برداري از پتانسيل انتقال مسافرين ترانزيتي از دبي به هند و همچنين از اروپا به خاور دور و شبه قاره هند از جمله اقدامات اين هواپيمايي است.

هواپيمايي ماهان در نظر دارد كه در آينده عمليات ترانزيت مسافر و بار را گسترش دهد. اميد است كه در سال 1388 نقاطي مانند سنگاپور و مانيل(فيليپين) نيز به شبكه پروازي اين هواپيمايي اضافه شوند.

در حال حاظر، هواپيمايي ماهان به 11 شهر داخل نيز برنامه پروازي دارد. لازم به ذكر است كه بيش از نيمي از 5/1 ميليون نفر مسافر حمل شده در سال 1383، در مسيرهاي داخلي جابه‌جا شده‌اند.

در حال حاضر هواپيمايي ماهان عضو سازمان بين الملليIATA است و 2200 نفر كارمند دارد.

جهت كسب اطلاعات بيشتر در رابطه با برنامه پروازها ، دفاتر فروش رسمي ماهان در داخل و خارج كشور و نيز رزرو اينترنتي به وب سايت ماهان مراجعه نمائيد.